{"id":921,"date":"2020-06-18T18:28:09","date_gmt":"2020-06-18T16:28:09","guid":{"rendered":"https:\/\/us.edu.pl\/instytut\/ibbios\/?page_id=921"},"modified":"2023-02-15T13:36:19","modified_gmt":"2023-02-15T12:36:19","slug":"biotechnologia-i-biologia-eksperymentalna-roslin","status":"publish","type":"page","link":"https:\/\/us.edu.pl\/instytut\/ibbios\/nauka\/kierunki-badawcze\/biotechnologia-i-biologia-eksperymentalna-roslin\/","title":{"rendered":"Biotechnologia i biologia eksperymentalna ro\u015blin"},"content":{"rendered":"<p>[vc_row][vc_column]\r\n                <div class=\"text-modules \">\r\n                    <div class=\"container\">\r\n                        <h3 class=\"section-title section-title_border-bottom\">Biotechnologia i biologia eksperymentalna ro\u015blin<\/h3> <h3 class=\"subtitle text-modules__subtitle\">Prace naukowe w zakresie biotechnologii i biologii eksperymentalnej ro\u015blin koncentruj\u0105 si\u0119 na nast\u0119puj\u0105cych tematach badawczych:<\/h3>\r\n                        <div class=\"row m-0\">\r\n                            <div class=\"text-modules__content\">\r\n                                <span style=\"font-size: 12pt;\"><strong>1.\u00a0<\/strong><strong>Analiza struktury i ewolucji genomu ro\u015blinnego na poziomie cytomolekularnym.<\/strong><\/span><\/p>\n<p><span style=\"font-size: 12pt;\">Badania te obejmuj\u0105 analiz\u0119 struktury chromatyny w r\u00f3\u017cnych fazach cyklu kom\u00f3rkowego, analiz\u0119 wielko\u015bci genom\u00f3w j\u0105drowych u r\u00f3\u017cnych gatunk\u00f3w oraz fizycznej lokalizacji gen\u00f3w i niekoduj\u0105cych sekwencji DNA, w tym gen\u00f3w odpowiadaj\u0105cych za wa\u017cne cechy u\u017cytkowe u ro\u015blin uprawnych. Przedmiotem bada\u0144 jest r\u00f3wnie\u017c detekcja i charakterystyka przemian chromosomowych, zachodz\u0105cych podczas proces\u00f3w filogenetycznych, ontogenetycznych i w wyniku zabieg\u00f3w biotechnologicznych. Oceniana jest tak\u017ce stabilno\u015b\u0107 genomu ro\u015blinnego poddanego dzia\u0142aniu fizycznych i chemicznych czynnik\u00f3w mutagennych. Badania prowadzone s\u0105 cz\u0119sto na gatunkach uznanych za modelowe, co zwi\u0119ksza interdyscyplinarno\u015b\u0107 i z\u0142o\u017cono\u015b\u0107 analiz.<\/span> \r\n                                <div class=\"mt-3\"><\/div>\r\n                            <\/div>\r\n                            \r\n                            <div class=\"text-modules__img\"><img src=\"https:\/\/us.edu.pl\/instytut\/ibbios\/wp-content\/uploads\/sites\/36\/2023\/02\/microscope-g35840c6b9_640-300x200.jpg\" alt=\"img\"><\/div>\r\n                        <\/div>\r\n                    <\/div>\r\n                <\/div>\r\n                <div class=\"text-modules\">\r\n                    <div class=\"container\">\r\n                        \r\n                        <div class=\"text-modules__content\"><p><span style=\"font-size: 12pt;\"><strong>2.\u00a0<\/strong><strong>Genomika funkcjonalna ro\u015blin uprawnych i modelowych.<\/strong><\/span><\/p>\n<p><span style=\"font-size: 12pt;\">Prowadzone badania maj\u0105 na celu identyfikacj\u0119 i okre\u015blenie roli gen\u00f3w zwi\u0105zanych z wybranymi procesami rozwojowymi ro\u015blin oraz gen\u00f3w kontroluj\u0105cych reakcj\u0119 ro\u015blin na stresy abiotyczne. Podstawowymi obiektami bada\u0144 s\u0105: gatunek uprawny (<em>Hordeum vulgare<\/em>) oraz modelowy (<em>Arabidopsis thaliana<\/em>). U\u00a0<em>H. vulgare<\/em>\u00a0badania dotycz\u0105 identyfikacji i charakterystyki dzia\u0142ania gen\u00f3w: <\/span><\/p>\n<ul>\n<li><span style=\"font-size: 12pt;\">kontroluj\u0105cych rozw\u00f3j systemu korzeniowego, ze szczeg\u00f3lnym uwzgl\u0119dnieniem w\u0142o\u015bnik\u00f3w; <\/span><\/li>\n<li><span style=\"font-size: 12pt;\">zwi\u0105zanych z metabolizmem brassinosteroid\u00f3w i strigolaktan\u00f3w w aspekcie ich roli w rozwoju p\u0119du;<\/span><\/li>\n<li><span style=\"font-size: 12pt;\">zwi\u0105zanych z reakcj\u0119 ro\u015blin na stresy abiotyczne ze szczeg\u00f3lnym uwzgl\u0119dnieniem stresu niedoboru wody;<\/span><\/li>\n<li><span style=\"font-size: 12pt;\">odpowiedzialnych za procesy naprawy DNA. <\/span><\/li>\n<\/ul>\n<p><span style=\"font-size: 12pt;\">Prowadzone s\u0105 tak\u017ce prace nad okre\u015bleniem roli epigenetycznych modyfikacji, w szczeg\u00f3lno\u015bci metylacji DNA, w adaptacji ro\u015blin do warunk\u00f3w stresowych. Odr\u0119bnym przedmiotem bada\u0144 s\u0105 genetyczne i epigenetyczne mechanizmy kontroluj\u0105ce procesy regeneracji ro\u015blin w kulturze <em>in vitro<\/em>, badane u\u00a0<em>A. thaliana<\/em>\u00a0w aspekcie identyfikacji kluczowych gen\u00f3w determinuj\u0105cych plastyczno\u015b\u0107 rozwojow\u0105 ro\u015blin oraz ich regulacji na poziomie transkrypcyjnym i potranskrypcyjnym. U j\u0119czmienia prowadzone s\u0105 prace nad identyfikacj\u0105 molekularnych mechanizm\u00f3w prowadz\u0105cych do albinizmu w kulturze izolowanych mikrospor\u00a0<em>in vitro<\/em>.<\/span><\/p>\n<\/div>\r\n                    <\/div>\r\n                <\/div>\r\n                <div class=\"text-modules reverse\">\r\n                    <div class=\"container\">\r\n                         \r\n                        <div class=\"row m-0\">\r\n                            <div class=\"text-modules__content\">\r\n                                <span style=\"font-size: 12pt;\"><strong>3. Analizy morfogenetyczne i matematyczne modelowanie wzrostu i rozwoju organ\u00f3w ro\u015blinnych<\/strong><strong>.<\/strong><\/span><\/p>\n<p><span style=\"font-size: 12pt;\">Badania dotycz\u0105 regulacji morfogenezy organ\u00f3w i tkanek ro\u015blinnych ze szczeg\u00f3lnym uwzgl\u0119dnieniem morfogenezy wierzcho\u0142ka korzenia i p\u0119du oraz powstawania organ\u00f3w bocznych. Modelowanie oraz ilo\u015bciowa analiza wzrostu i geometrii organ\u00f3w wzbogacone s\u0105 badaniami biomechanicznych podstaw wzrostu, w tym roli cytoszkieletu i w\u0142a\u015bciwo\u015bci mechanicznych \u015bciany kom\u00f3rkowej w regulacji wzrostu merystem\u00f3w apikalnych i bocznych. Modelowanie matematyczne wzrostu z uwzgl\u0119dnieniem ukierunkowanych podzia\u0142\u00f3w kom\u00f3rek i symulacje komputerowe oparte s\u0105 na danych empirycznych. Umo\u017cliwia to w uj\u0119ciu biomechanicznym rozpoznawanie cech fenotypowych wa\u017cnych w hodowli ro\u015blin u\u017cytkowych.<\/span> \r\n                                <div class=\"mt-3\"><\/div>\r\n                            <\/div>\r\n                            \r\n                            <div class=\"text-modules__img\"><img src=\"https:\/\/us.edu.pl\/instytut\/ibbios\/wp-content\/uploads\/sites\/36\/Bez-kategorii\/root-ga54388839_640-300x200.jpg\" alt=\"img\"><\/div>\r\n                        <\/div>\r\n                    <\/div>\r\n                <\/div>\r\n                <div class=\"text-modules\">\r\n                    <div class=\"container\">\r\n                        \r\n                        <div class=\"text-modules__content\"><p><span style=\"font-size: 12pt;\"><strong>4. Geneza i funkcja potencja\u0142\u00f3w elektrycznych u ro\u015blin<\/strong><strong>.<\/strong><\/span><\/p>\n<p><span style=\"font-size: 12pt;\">Powstawanie elektrycznych gradient\u00f3w jest fundamentalnym przejawem przekazywania sygna\u0142\u00f3w\u00a0 u\u00a0ro\u015blin. Badania dotycz\u0105 zmian potencja\u0142u membranowego plazmalemmy i modulacji aktywno\u015bci wolnych kana\u0142\u00f3w wakuolarnych (SV channels) w odpowiedzi na \u015bwiat\u0142o, temperatur\u0119, metale ci\u0119\u017ckie, hormony i inne czynniki. W badaniach zastosowane s\u0105 dwie podstawowe techniki \u2013 technika patch\u2011clamp i elektrod wewn\u0105trzkom\u00f3rkowych.<\/span><\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<p><span style=\"font-size: 12pt;\"><strong>5. Analizy komunikacji symplastowej oraz udzia\u0142u fizyko-chemicznych zmian \u015bciany kom\u00f3rkowej w\u00a0r\u00f3\u017cnicowaniu kom\u00f3rek<\/strong><strong>.<\/strong><\/span><\/p>\n<p><span style=\"font-size: 12pt;\">Mechanizmy r\u00f3\u017cnicowania kom\u00f3rek ro\u015blinnych poznawane s\u0105 w aspekcie komunikacji symplastowej oraz zmian fizyko-chemicznych \u015bciany kom\u00f3rkowej. Badania komunikacji symplastowej dotycz\u0105 analizy tworzenia domen symplastowych w rozwoju ro\u015blin od zarodka do siewki oraz ich roli w powstawaniu tkanek i organ\u00f3w a tak\u017ce zmian tego procesu, wymuszanych warunkami \u015brodowiska. Analizy tego typu mog\u0105 si\u0119 przyczyni\u0107 si\u0119 do pe\u0142niejszego poznania roli symplastu i apoplastu w rozwoju ro\u015blin, a co za tym idzie wykorzystania w przysz\u0142o\u015bci tej wiedzy do \u201eprojektowania\u201d ro\u015blin o wymaganych cechach.<\/span><\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<p>\n<\/div>\r\n                    <\/div>\r\n                <\/div>\r\n                <div class=\"text-modules reverse\">\r\n                    <div class=\"container\">\r\n                         \r\n                        <div class=\"row m-0\">\r\n                            <div class=\"text-modules__content\">\r\n                                <\/p>\n<h3><span style=\"font-size: 12pt;\"><strong>W badaniach wykorzystuje si\u0119 nast\u0119puj\u0105ce metody badawcze:<\/strong><\/span><\/h3>\n<ul>\n<li><span style=\"font-size: 12pt;\">cytometri\u0119 przep\u0142ywow\u0105 i obrazow\u0105;<\/span><\/li>\n<li><span style=\"font-size: 12pt;\">techniki cytogenetyki molekularnej, m. in. fluorescencyjn\u0105 hybrydyzacj\u0119 DNA-DNA\u00a0<em>in situ<\/em>\u00a0i immunobarwienia;<\/span><\/li>\n<li><span style=\"font-size: 12pt;\">testy genotoksyczno\u015bci (TUNEL, kometowy);<\/span><\/li>\n<li><span style=\"font-size: 12pt;\">techniki obrazowania 3D z wykorzystaniem mikroskopii konfokalnej i zaawansowanych metod cyfrowej obr\u00f3bki obrazu;<\/span><\/li>\n<li><span style=\"font-size: 12pt;\">techniki edycji genomu i mutagenezy ukierunkowanej (system CRISPR\/Cas9)<\/span><\/li>\n<li><span style=\"font-size: 12pt;\">transmisyjn\u0105 i skaningow\u0105 mikroskopi\u0119 elektronow\u0105;<\/span><\/li>\n<li><span style=\"font-size: 12pt;\">markery molekularne (AFLP, SSR, SNP);<\/span><\/li>\n<li><span style=\"font-size: 12pt;\">klonowanie i sekwencjonowanie i DNA, w tym sekwencjonowanie z wykorzystaniem NGS;<\/span><\/li>\n<li><span style=\"font-size: 12pt;\">analizy transkryptom\u00f3w z wykorzystaniem mikromacierzy DNA, Real-Time qPCR; RNA-seq<\/span><\/li>\n<li><span style=\"font-size: 12pt;\">metody analizy r\u00f3\u017cnicowej proteom\u00f3w;<\/span><\/li>\n<li><span style=\"font-size: 12pt;\">strategi\u0119 TILLING;<\/span><\/li>\n<li><span style=\"font-size: 12pt;\">techniki bioinformatyczne;<\/span><\/li>\n<li><span style=\"font-size: 12pt;\">techniki kultur\u00a0<em>in vitro\u00a0<\/em>ro\u015blin, kultury pylnikowe, kultury izolowanych mikrospor i kultury protoplast\u00f3w;<\/span><\/li>\n<li><span style=\"font-size: 12pt;\">techniki transformacji genetycznej z wykorzystaniem\u00a0<em>Agrobacterium<\/em>;<\/span><\/li>\n<li><span style=\"font-size: 12pt;\">klasyczne pomiary elektrofizjologiczne; pomiary technik\u0105 patch clamp; kom\u00f3rkow\u0105 sond\u0119 ci\u015bnieniow\u0105;<\/span><\/li>\n<li><span style=\"font-size: 12pt;\">badania tensometryczne z wykorzystaniem test\u00f3w reologicznych;<\/span><\/li>\n<li><span style=\"font-size: 12pt;\">modelowanie komputerowe wzrostu i rozwoju organ\u00f3w ro\u015blin z zastosowaniem metody tensora wzrostu w uj\u0119ciu biomechanicznym<\/span><\/li>\n<li><span style=\"font-size: 12pt;\">wykorzystaniem metod numerycznych;<\/span><\/li>\n<li><span style=\"font-size: 12pt;\">immunohistochemia na poziomie mikroskopu \u015bwietlnego i elektronowego<\/span><\/li>\n<li><span style=\"font-size: 12pt;\">wykorzystanie fluorochrom\u00f3w do analizy komunikacji symplastowej w warunkach\u00a0<em>in vivo<\/em>\u00a0i\u00a0<em>in vitro<\/em>\u00a0na poziomie mikroskopu \u015bwietlnego (jasne pole i mikroskop konfokalny).<\/span><\/li>\n<\/ul>\n<div class=\"mt-3\"><\/div>\r\n                            <\/div>\r\n                            \r\n                            <div class=\"text-modules__img\"><img src=\"https:\/\/us.edu.pl\/instytut\/ibbios\/wp-content\/uploads\/sites\/36\/Bez-kategorii\/analysis-g17f692f82_1280-300x200.jpg\" alt=\"img\"><\/div>\r\n                        <\/div>\r\n                    <\/div>\r\n                <\/div>[\/vc_column][\/vc_row]<\/p>","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>[vc_row][vc_column][\/vc_column][\/vc_row] [&#8230;]<\/p>\n<p><a class=\"btn btn-secondary understrap-read-more-link\" href=\"https:\/\/us.edu.pl\/instytut\/ibbios\/nauka\/kierunki-badawcze\/biotechnologia-i-biologia-eksperymentalna-roslin\/\">Read More&#8230;<\/a><\/p>\n","protected":false},"author":114,"featured_media":0,"parent":161,"menu_order":3,"comment_status":"closed","ping_status":"closed","template":"page-templates\/inner-page.php","meta":{"_expiration-date-status":"","_expiration-date":0,"_expiration-date-type":"","_expiration-date-categories":[],"_expiration-date-options":[]},"acf":[],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/us.edu.pl\/instytut\/ibbios\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/921"}],"collection":[{"href":"https:\/\/us.edu.pl\/instytut\/ibbios\/wp-json\/wp\/v2\/pages"}],"about":[{"href":"https:\/\/us.edu.pl\/instytut\/ibbios\/wp-json\/wp\/v2\/types\/page"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/us.edu.pl\/instytut\/ibbios\/wp-json\/wp\/v2\/users\/114"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/us.edu.pl\/instytut\/ibbios\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=921"}],"version-history":[{"count":5,"href":"https:\/\/us.edu.pl\/instytut\/ibbios\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/921\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":5486,"href":"https:\/\/us.edu.pl\/instytut\/ibbios\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/921\/revisions\/5486"}],"up":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/us.edu.pl\/instytut\/ibbios\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/161"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/us.edu.pl\/instytut\/ibbios\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=921"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}