Zespół Genetyki i Genomiki Funkcjonalnej Roślin

Temat badawczy: Identyfikacja, badanie funkcji i mechanizmów regulacji genów związanych z wybranymi procesami rozwojowymi i odpowiedzią na stresy środowiskowe u roślin

Obiektem badań jest gatunek uprawny – jęczmień (Hordeum vulgare) oraz gatunek modelowy – Arabidopsis thaliana. Główny materiał badawczy stanowi wyprowadzona we wcześniejszych badaniach populacja TILLING jęczmienia, a także mutanty Arabidopsis i linie CRISPR/Cas obu gatunków. Badania prowadzone są z wykorzystaniem narzędzi genomiki translacyjnej i transkryptomiki, ze szczególnym uwzględnieniem analiz opartych o sekwencjonowanie wysokoprzepustowe (NGS), a także technik transformacji genetycznej i edytowania genów.

Szczegółowa problematyka badawcza zespołu obejmuje następujące zagadnienia

poszukiwanie genów kontrolujących mechanizmy tolerancji na stres suszy i inne stresy abiotyczne związane ze zmianami klimatu (wysoka temperatura, zalewanie, zasolenie) u jęczmienia,
wyjaśnienie funkcji wybranych regulatorów sygnalizacji kwasu abscysynowego, a także metabolizmu brassinosteroidów, strigolaktonów i jasmonianów w odpowiedzi na stresy środowiskowe,
analiza funkcjonalna genów związanych z metabolizmem brassinosteroidów i strigolaktonów w aspekcie ich roli w procesach wzrostu i rozwoju roślin,
identyfikacja i analiza funkcji genów związanych z odpowiedzią na uszkodzenia DNA na drodze DDR (DNA damage response), w tym zmiany wywołane stresami środowiskowymi,
badania molekularnych podstaw rozwoju włośników u jęczmienia,
badania genetycznych i epigenetycznych mechanizmów kontrolujących procesy regeneracji roślin w kulturze in vitro, ze szczególnym uwzględnieniem procesu embriogenezy mikrospor u jęczmienia.

Przedstawiona tematyka badawcza jest zgodna z Priorytetowymi Obszarami Badawczymi wskazanymi w Strategii Rozwoju UŚ (POB3, POB5) oraz z najważniejszymi obszarami badawczymi w dyscyplinie nauki biologiczne, wskazanymi w Strategii Rozwoju Instytutu Biologii, Biotechnologii i Ochrony Środowiska UŚ na lata 2020-2025 (obszary badawcze dyscypliny 1, 2, 3).

Słowa kluczowe:

Genomika funkcjonalna roślin
Transkryptomika
Stres abiotyczny
Genetyka roślin
Jęczmień

Skład zespołu

Dr hab. Agata Daszkowska-Golec, prof. UŚ– lider zespołu
Dr Monika Gajecka
Mgr Katarzyna Gajek
Dr hab. Damian Gruszka, prof. UŚ
Dr hab. Agnieszka Janiak, prof. UŚ
Dr Marzena Kurowska
Dr Marek Marzec, prof. UŚ
Prof. dr hab. Iwona Szarejko
Dr Miriam Szurman-Zubrzycka
Dr Anna Collin
Dr Justyna Guzy-Wróbelska
Dr Beata Chmielewska
Mgr Ewa Sybilska
Mgr Grażyna Skawińska-Zydroń
Justyna Zbieszczyk
Israel Akinlabi
Mgr Sunny Ahmar
Mgr Magdalena Korek
Mgr Hubert Matkowski