Zespół Genetyki i Genomiki Funkcjonalnej Roślin
Identyfikacja, badanie funkcji i mechanizmów regulacji genów związanych z wybranymi procesami rozwojowymi i odpowiedzią na stresy środowiskowe u roślin 22) cKrótki opis problematyki badawczej (maksymalnie 1500 znaków bez spacji)
Obiektem badań jest gatunek uprawny – jęczmień (Hordeum vulgare) oraz gatunek modelowy – Arabidopsis thaliana. Główny materiał badawczy stanowi wyprowadzona we wcześniejszych badaniach populacja TILLING jęczmienia, a także mutanty Arabidopsis i linie CRISPR/Cas obu gatunków. Badania prowadzone są z wykorzystaniem narzędzi genomiki translacyjnej i transkryptomiki, ze szczególnym uwzględnieniem analiz opartych o sekwencjonowanie wysokoprzepustowe (NGS), a także technik transformacji genetycznej i edytowania genów.
Szczegółowa problematyka badawcza zespołu obejmuje następujące zagadnienia:
- poszukiwanie genów kontrolujących mechanizmy tolerancji na stres suszy i inne stresy abiotyczne związane ze zmianami klimatu (wysoka temperatura, zalewanie, zasolenie) u jęczmienia,
- wyjaśnienie funkcji wybranych regulatorów sygnalizacji kwasu abscysynowego, a także metabolizmu brassinosteroidów, strigolaktonów i jasmonianów w odpowiedzi na stresy środowiskowe,
- analiza funkcjonalna genów związanych z metabolizmem brassinosteroidów i strigolaktonów w aspekcie ich roli w procesach wzrostu i rozwoju roślin,
- identyfikacja i analiza funkcji genów związanych z odpowiedzią na uszkodzenia DNA na drodze DDR (DNA damage response), w tym zmiany wywołane stresami środowiskowymi,
- badania molekularnych podstaw rozwoju włośników u jęczmienia,
- badania genetycznych i epigenetycznych mechanizmów kontrolujących procesy regeneracji roślin w kulturze in vitro, ze szczególnym uwzględnieniem procesu embriogenezy mikrospor u jęczmienia.
Przedstawiona tematyka badawcza jest zgodna z Priorytetowymi Obszarami Badawczymi wskazanymi w Strategii Rozwoju UŚ (POB3, POB5) oraz z najważniejszymi obszarami badawczymi w dyscyplinie nauki biologiczne, wskazanymi w Strategii Rozwoju Instytutu Biologii, Biotechnologii i Ochrony Środowiska UŚ na lata 2020-2025 (obszary badawcze dyscypliny 1, 2, 3).
Skład zespołu
- Dr hab. Agata Daszkowska-Golec, prof. UŚ – lider zespołu
- Dr Monika Gajecka
- Mgr Katarzyna Gajek
- Dr hab. Damian Gruszka, prof. UŚ
- Dr hab. Agnieszka Janiak, prof. UŚ
- Dr Marzena Kurowska
- Dr Marek Marzec, prof. UŚ
- Prof. dr hab. Iwona Szarejko
- Dr Miriam Szurman-Zubrzycka
- Dr Anna Collin
- Dr Justyna Guzy-Wróbelska
- Dr Beata Chmielewska
- Mgr Ewa Sybilska
- Mgr Grażyna Skawińska-Zydroń
- Justyna Zbieszczyk
- Israel Akinlabi
- Mgr Sunny Ahmar
- Mgr Magdalena Korek
- Mgr Hubert Matkowski